А он там есть? Если нет, надо сказать cvsup -L1 -h cvsup.freebsd.org /usr/src/share/examples/cvsup/ports-supfile. Надеюсь там этот файл никто не редактировал. Если редактировал, то вытащить оригинальный ports-supfile любым способом, хоть через cvsweb, хоть обновлением src до RELENG_4.